我國實行根本藥物制度，比其他國家更為復雜。這是由于，醫藥行業還處在“小、散、亂”的初級發展階段，醫療效勞體系還沒有完成公益性。當前人們感遭到的一些根本藥物制度帶來的問題，本質是醫藥產業和醫療效勞體系長期積聚的問題在該制度上的表現。

首先，我國醫療效勞和藥物供應的構造不合理，適合技術、適合藥物供應缺乏，過度用藥、不合理用藥十分嚴重。根本藥物制度在推進適合用藥、轉變醫學形式、進步和標準藥物質量方面起到了深遠作用。

其次，以藥養醫，是當前醫療衛生范疇最突出的問題。不處理以藥養醫，即便醫保擴面提標了，藥物費用仍會疾速增加。因而，必需充分發揮根本藥物制度推進醫療衛生變革的作用。

第三，我國目前有上萬家藥物消費和流通企業，范圍小，監管難，研發和國際競爭力弱，必需走構造調整、產業整合的道路。根本藥物制度統一招標采購，正是用市場化手腕推進醫藥產業整合的有效方法。在整合過程中，必然會有一些競爭力弱、范圍小的企業淘汰。當然，在整合過程中要采取適宜的產業政策，扶持有競爭力的企業，還要把握好力度和速度。

第四，長期以來，我國構成了一些寄生在藥物流通產業鏈上的既得群體，根本藥物制度觸及到了這些利益。實行根本藥物招標采購，一局部企業、流通環節以及局部醫務人員的利益都遭到了損傷，應借此機會從其他方面進步醫務人員的合理待遇，對流通環節，必需堅持標準和整理藥物流通次序。

施行根本藥物制度以來呈現的一些問題，不是根本藥物制度本身的方向問題，而是這一制度把原來固有的矛盾暴露了出來，主要是由于舊體制機制同根本藥物這項新制度不適應。

例如，一些省份實行量價掛鉤之后，企業反映市場比變革前縮小了，這是由于完成了合理用藥，等運行一兩年之后，市場范圍就比較容易確定了；有的反映搞根本藥物制度之后鄉鎮衛生院效勞量下降，這一方面是由于減少了過度醫療，把重癥病人轉上去了，另一方面，等政策穩定一段時間，縣醫院變革完成后，更多的患者還會回到基層。

總的來說，根本藥物制度的方向是完全正確的，應著力鞏固完善現有政策。否則，不僅會動搖變革成果，還會給市場發出錯誤的信號，以后再進行變革就更困難。